Изучение взаимодействия белков in silico на примере белка Nef вируса ВИЧ-1 и белка калнексина человека

Анашкина А.А.

17.09.15, Четверг, 15:00, ИПУ им. В.А.Трапезникова РАН, ауд.1

Базовый семинар: Математическое моделирование и системная биология

ВИЧ-1 Nef это мультифункциональный белок, участвующий в регуляции вирусной инфекции, и отвечающий за целый ряд патогенных эффектов ВИЧ инфекции. В частности, у больных, инфицированных ВИЧ, наблюдается повышенный риск развития атеросклероза. Снижение активности транспортера холестерина ABCA1 под действием белка ВИЧ-1 Nef является важным фактором патогенеза этого заболевания.

В рамках данного проекта охарактеризовано ранее не изучавшееся взаимодействие Nef-калнексин с использованием биоинформатических подходов и идентифицированы потенциальные сайты Nef и цитоплазматического домена калнексина, ответственные за это взаимодействие. Кроме того, предсказаны лиганды – химические вещества, взаимодействующие с сайтом связывания на белке Nef и препятствующие взаимодействию с калнексином. Эффективность двух из десяти предсказанных веществ доказана экспериментально.

 

Следующий семинар: 29.10.2015 - Стохастическая дискретно-непрерывная модель кроветворения человека (докладчик: Русинов М.А.).

Предыдущий семинар: 09.04.2015 - Средняя и видовая продолжительности жизни как подукт эволюции (докладчик: Овсянников Л.Л.).